역사는 1990년 준공으로, 설계는 오이타현 출신의 건축가 이소자키 아라타.
주변 유후인 역 에서는 거의 볼 수 없는 유후인역의 여러가지 특징이 있어, 디자인을 고집한 역사의 선구자입니다.
역사의 내외를 멀리서도 넓게 눈에 띄게 보이기 위해,
로비가 높이 12m의 뿜어져 있는 등 유후인 유후인 온천 입구에 어울리는 모습이 되고 있습니다.
또, 대합실에서는 1개월마다 전시물이 바뀌어, 미술관과 같은 아트 갤러리로도 되어 있습니다.
실용적인 면에서도 동계의 냉기가 가혹한 주변의 환경이 고려되고 있어, 바람을 막는 대형으로 두꺼운 유리문이나 온천수를 이용한 바닥 난방의 설비가 있습니다.